基因挖掘来了！实战转录组基因数据分析 数据分析在生命科学与医学领域的最前沿实践
基因挖掘来了！实战转录组基因数据分析 数据分析在生命科学与医学领域的最前沿实践转录组基因数据分析是一个非常前卫的IT技术分支，但通过这次的课程，同学们对转录组基因数据分析将不再陌生。转录组数据分析一般分为所有基因挖掘、差异基因挖掘、表达量挖掘、高级工具挖掘四个步骤，在本次的课程中我们不仅要对转录组进行数据分析和挖掘，还对转录组技术理论进行了非常深入的研究和探讨，更进一步的进行了数据的可视化分析报告，这对于更好的理解以及转录组数据分析有更实际的应用。
===============课程目录===============
(1)\01、转录组基础
├─01、转录组基础（上）.mp4
├─02、转录组基础（下）.mp4
├─11-转录组概述(1).pdf
├─11-转录组概述.pdf
(2)\02、Windows下转录组分析软件的安装
├─01、Windows下转录组分析软件安装.mp4
├─02、Windows软件安装-510.mp4
├─转录组数据分析软件安装-Windows.zip
(3)\03、Linux下的软件安装和一键配置转录组运行环境
├─01、Linux下软件安装和一键配置转录组运行环境.mp4
├─02、Linux下软件安装-510.mp4
├─13-1-转录组软件安装-Linux(1).pdf
├─13-1-转录组软件安装-Linux.pdf
(4)\04、转录组Salmon分析流程讲解
├─01、Salmon基础.mp4
├─02、Salmon实战操作.mp4
├─03、Salmon理论-510.mp4
├─04、Salmon实战-510.mp4
├─12-转录组分析流程Salmon(1).pdf
├─12-转录组分析流程Salmon.pdf
├─13_salmon_deseq2_go.zip
├─transcriptome_server.zip
(5)\05、DESeq2差异基因分析理论和操作
├─01、DESeq2差异基因分析理论和操作1.mp4
├─02、DESeq2理论-510.mp4
├─03、DESeq2差异基因分析理论和操作2.mp4
├─04、DESeq2实战-510.mp4
├─14-差异基因分析理论和实战(1).pdf
├─14-差异基因分析理论和实战.pdf
(6)\06、GO、KEGG富集分析理论和可视化讲解
├─01、GO KEGG富集分析理论和可视化讲解.mp4
├─02、GO KEGG msigdb富集分析和可视化实战.mp4
├─03、GO富集理论-510.mp4
├─04、GO富集操作+Cytoscape_clueGO-510.mp4
├─15_16-GOGSEA富集分析原理和操作(1).pdf
├─15_16-GOGSEA富集分析原理和操作.pdf
├─goeast.txt
(7)\07、利用Cytoscape-clueGO进行富集分析
├─01、Cytoscape富集可视化Pathway通路映射.mp4
├─02、Cytoscape clueGO进行富集分析和网络可视化.mp4
├─03、Cytoscape理论和pathway-510.mp4
├─25-Cytoscape绘制网路通路图(1).pdf
├─25-Cytoscape绘制网路通路图.pdf
├─cytoscape演示数据.zip
├─KEGG.zip
(8)\08、GSEA富集分析理论和可视化案例讲解
├─01、GSEA富集分析理论和可视化案例讲解（GO、KEGG、MsigDB）.mp4
├─02、GSEA两组样品和时间序列富集分析.mp4
├─03、GSEA理论-510.mp4
├─04、GSEA实战-510.mp4
├─15_GSEA.zip
(9)\09、二代和三代高通量测序原理
├─01、二代和三代高通量测序原理.mp4
├─02、中心法则测序应用-510.mp4
├─03、测序原理-510.mp4
├─21-二代测序平台和原理(1).pdf
├─21-二代测序平台和原理.pdf
(10)\10、转录组STAR比对分析流程讲解
├─01、转录组STAR比对分析流程讲解.mp4
├─02、STAR有参操作解释-510.mp4
├─03、STAR有参操作总结-510.mp4
├─22-转录分析流程STAR(1).pdf
├─22-转录分析流程STAR.pdf
(11)\11、转录组STAR比对分析实战与IGV可视化、比对评估、饱和性检测
├─01、转录组STAR比对分析实战和IGV可视化 比对评估 饱和性检测.mp4
├─02、IGV可视化-510.mp4
├─23-转录组分析流程-IGV(1).pdf
├─23-转录组分析流程-IGV.pdf
(12)\12、STAR定量结果差异基因分析和与Salmon结果比较
├─01、STAR定量结果差异基因分析和与salmon结果比较.mp4
├─23_star_deseq2_go.zip
(13)\13、WGCNA理论分析和注意事项、案例解读
├─01、WGCNA理论-510.mp4
├─02、WGCNA理论分析和注意事项、案例解读.mp4
├─24-WGCNA共表达网络分析(1).pdf
├─24-WGCNA共表达网络分析.pdf
(14)\14、WGCNA共表达实战
├─01、WGCNA实战和网络可视化-510.mp4
├─02、WGCNA共表达实战.mp4
├─24_WGCNA.zip
(15)\15、转录组组装和可变剪接分析理论和实战
├─01、转录组组装和可变剪接分析理论和实战.mp4
├─31-转录本拼装和可变剪接.pdf
(16)\16、无参转录组分析理论
├─01、无参转录组分析理论.mp4
├─32-无参转录组组装和注释.pdf
(17)\17、单细胞转录组概念
├─01、单细胞转录组概念.mp4
├─31-单细胞转录组基本概念.pdf
(18)\18、单细胞转录组实战
├─01、10X拆库浏览.mp4
├─02、单细胞转录组数据获取-510.mp4
├─03、seurat-monocle-scater包解释和运行.mp4
├─32-单细胞转录组实战.pdf
├─33-单细胞转录组数据获取.pdf
(19)\19、PCA、TSNE、单细胞理论和操作
├─01、PCA TSNE理论.mp4
├─02、PCA TSNE单细胞操作.mp4
├─34-PCA和单细胞可视化.pdf
├─PCA_scRNA.zip
(20)\20、常用转录组资源数据库简介
├─01、常用转录组资源数据库简介.mp4
├─33-转录组案例分析和基因表达资源数据库.pdf
(21)\21、常见图形解读
├─01、常见图形解读.mp4
├─02、常见图形解释-510.mp4
├─26-转录组常用图形解读(1).pdf
├─26-转录组常用图形解读.pdf
(22)\22、AdobeIllustrator修图和拼图
├─01、AdobeIllustrator修图和拼图.mp4
├─36_AI.zip
├─36论文图表.pdf
(23)\23、Linux基础（一）晚间额外课
├─01、Linux基础 （一）晚间额外课.mp4
├─Linux基础.zip
├─linux简介与实操.pdf
(24)\24、Linux基础（二）晚间额外课
├─01、Linux基础（二）晚间额外课.mp4
(25)\25、Excel便捷操作
├─01、excel操作-510.mp4
├─Excel.190511.pptx
(26)\26、发表文章相关知识
├─01、发表文章-510.mp4
├─35_发表前准备.pdf
(27)\27、两周后的答疑
├─01、两周后的答疑.mp4
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